近期，生物医学研究中心病毒遗传与基因工程团队在国际学术期刊Virulence（农林科学1区）发表题为“Mapping evolutionary paradigm of Oropouche virus driven by dinucleotide bias and context-dependent codon bias”的学术论文。该论文从OROV病毒核苷酸不同组合形式所蕴含的蛋白遗传特征进行了较为系统的阐述，为进一步了解这些主要蛋白在OROV病毒生命周期中所发挥的生物学作用提供了新思路。
奥罗普切热病毒（Oropouche virus，OROV）是布尼亚病毒科（Peribunyaviridae）的成员之一，通过库蠓和蚊虫叮咬传播疾病，可以引起宿主突发高热、头痛、肌肉痛等。本文以45个不同基因型的OROV毒株为研究对象，评估核蛋白、糖蛋白和RdRp蛋白演化的选择压力。信息熵、二核苷酸比值比、相对同义密码子使用值和情境依赖密码子偏差来阐明与单核、二核苷酸、三核苷酸和四核苷酸组成相关的遗传特征。整体核苷酸使用偏差、二核苷酸偏差和同义密码子使用偏差的程度与基因型特异性模式无关，而是在三种蛋白质中表现出蛋白质功能依赖的模式。尽管二核苷酸偏嗜性和同义密码子使用偏嗜在相对宽范围内变化，但二核苷酸CpG、强偏嗜性同义密码子以及CDCB仍强烈受宿主和病毒生命周期的自然选择压力影响。此外，密码子的使用模式，如有效密码子数量所示，表明OROV核蛋白在其进化模式中受到更强的选择压力，而糖蛋白和RdRp主要受自然选择和突变压力影响。
生物医学研究中心病毒基因工程团队副教授周建华为论文通讯作者，博士研究生杨宣叶与硕士研究生刘泽煜为论文共同第一作者。该研究得到国家自然科学基金经费的支持。
文章链接：DOI: 10.1080/21505594.2025.2600128
