2002年初，经国家民委、教育部批准，在西北民族大学医学院筹建口腔医学专业，2005年教育部批准在医学院设立口腔医学（本科）专业，自2006年起开始招生本科生。2009年西北民族大学口腔医院建立；2013年10月西北民族大学附属口腔医院通过了甘肃省高等医学院校临床教学基地评审；2013年12月通过教育部口腔医学专业认证；西北民族大学口腔医院是国家民委所属院校中唯一承担口腔医学本科生培养的教育医疗机构，为西北民族大学和临夏技术学院口腔临床实习和见习基地，多次成功承办了中华口腔医学会口腔健康促进与口腔医学发展西部行（甘肃）大型公益活动、甘肃省口腔岗位技能大赛及各类学术培训活动。

西北民族大学口腔医院是集医疗、教学、科研、预防保健为一体的口腔专科医院，目前设有西北民族大学口腔医院和口腔医院白银路门诊部。医院总建筑面积2000平方米，使用面积1600平方米（包括业务用房和行政用房）。医院设置有口腔内科、口腔修复科、口腔种植科、口腔正畸科、口腔颌面外科、口腔预防保健科及口腔综合科等临床科室临床专业科室，目前拥有牙科综合治疗椅等齿科专用设备150余台，其中口腔显微镜根管诊疗系统、CAD/CAM(计算机辅助设计与制作)全瓷修复系统、锥束三维牙科CT等均为国内高、精、尖端设备，临床医用设备的齐备性以及先进性位列甘肃省前列。医院现已开展无牙颌种植与即刻修复技术、微创种植、即刻种植、CAD/CAM全瓷修复、咬合重建、前牙美学微创修复、根管显微治疗、微创拔牙、舌侧矫治及隐形矫治等新技术、新业务。

医院现有医护人员71人，其中在编人员43人，社聘人员28人，副高级职称以上20人。拥有国家民委教学名师1人，教育部口腔医学教学指导委员会委员1人，国家民委青年英才1人，国际牙医师学院院士4人，国家民委领军人才支持计划项目1人,甘肃省“555创新人才工程”第二层次人选1人,国家卫生和计划生育委员会住院医师规范化培训规划教材编委1人。近年来，医院先后承担国家自然科学基金项目7项，省部级项目20余项，拥有甘肃省基础研究创新团队1个，在国内外重要学术期刊中发表研究论文200余篇。

医院坚持“以病人为中心，以医疗质量为核心”的宗旨，力求使患者得到优质、方便、满意、一流的医疗和保健服务。